OVA的故事紧接着TV第13话，也就是被定性为13.5话，夏娜和吉田同学总因为某些小事而吵吵闹闹，就在这样的吵架拌嘴中，两人还是和悠二一起去...

新学期刚开始，高中生·坂井悠二一如往常过着“日常生活”。然而有一天，他冷不防遭遇红世之王手下的侵袭。受到一名能够把人的存在化为灵火，并吸取灵火的神秘男子法利亚格尼的攻击。悠二的“日常”生活因此整个脱节，然而就在同一时间，…

1555年，时为战国时代。有位青年怀抱着远大的梦想，被人称作大傻瓜的他正是后来的织田信长。有一位仰慕着青年的少女，被信长的梦想所吸引的她笑着说道“我要成为信长大人的忍者！”目标只有一个，那就是天下布武！

故事讲述了平凡的小学三年级的小学生高町奈叶,和一个来自异世界米德芝尔达,来挖掘到太古遗产(平行次元中存在的高度科技的文明的遗产)"圣石之种"而来的尤诺·斯克莱亚的魔法邂逅下,成为了与尤诺一起收集圣石之种的魔法少女.最终在时空管理…